微生物检验一层，主要用于病毒检测和微生物仪器室。包括有P2实验室、分子生物学检测及研究室、生化实验室、电镜室、微生物自动检测及药敏分析室、HIV初筛实验室、清洁消毒室、生物实验室等。
微生物检验二层，主要用于常规卫生检测和门诊体检部分样品的检测。包括有100级净化工作室、1000级净化工作室、常规微生物检测无菌室、肠道致病菌检测室、培养基配制及器械准备室、培养基及消毒器械保管库、器械清洗煮消室、器械及培养基灭菌室等。
理化检验层，主要用于理化检测。包括有理化常规操作室、紫外分光光度计室、原子吸收分光光度计室、电感耦合等离子体质谱室、液相色谱室、气相色谱及气相质谱室、天平室、样品湿式消化室、样品处理室、气库等